{"id":84224,"date":"2021-05-05T10:43:25","date_gmt":"2021-05-05T08:43:25","guid":{"rendered":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/?p=84224"},"modified":"2021-05-05T11:28:15","modified_gmt":"2021-05-05T09:28:15","slug":"desarrollan-un-nuevo-metodo-de-etiquetado-de-bases-de-adn-para-secuenciacion","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/desarrollan-un-nuevo-metodo-de-etiquetado-de-bases-de-adn-para-secuenciacion\/","title":{"rendered":"Desarrollan un nuevo m\u00e9todo de etiquetado de bases de ADN para secuenciaci\u00f3n"},"content":{"rendered":"

Una mol\u00e9cula de ADN est\u00e1 compuesta por un acoplamiento de cuatro bloques b\u00e1sicos, los nucle\u00f3tidos. La informaci\u00f3n gen\u00e9tica transportada dentro de la mol\u00e9cula est\u00e1 determinada por el orden de los nucle\u00f3tidos. El conocimiento del orden de estos bloques de acoplamiento, que se conoce como secuencia de ADN, es necesario para el diagn\u00f3stico de enfermedades y el an\u00e1lisis forense de ADN, por ejemplo. A pesar del gran progreso de los \u00faltimos a\u00f1os, los m\u00e9todos de secuenciaci\u00f3n de ADN actuales, t\u00edpicamente basados \u200b\u200ben el marcaje fluorescente, siguen siendo t\u00e9cnicas que requieren mucho tiempo y son relativamente caras, y adem\u00e1s tienen algunas limitaciones. De ah\u00ed que la comunidad cient\u00edfica est\u00e1 buscando de forma insistente nuevos enfoques que ayuden a simplificar y acelerar la secuenciaci\u00f3n.<\/p>\n

Un enfoque prometedor es el uso de detecci\u00f3n electroqu\u00edmica y los llamados marcadores redox, que son compuestos que pueden oxidarse o reducirse en electrodos. Un equipo de investigaci\u00f3n internacional en el que ha participado la URV ha conseguido dise\u00f1ar y sintetizar nucle\u00f3tidos artificiales con etiquetas especiales redox adheridas que pueden oxidarse en un electrodo de oro o carbono a un potencial espec\u00edfico para producir una se\u00f1al medible y anal\u00edticamente \u00fatil. Estos marcadores son carboranos, estructuras de jaula compuestas por \u00e1tomos de boro y carbono, en el que se pueden incorporar otros \u00e1tomos met\u00e1licos, como el hierro o el cobalto, afectando a sus propiedades electroqu\u00edmicas resultantes.<\/p>\n

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La estudiante de doctorado Cansu Yenice, que ha participado en la investigaci\u00f3n.<\/figcaption><\/figure>\n

Los nucle\u00f3tidos modificados se han dise\u00f1ado para que la enzima ADN polimerasa, que utiliza los componentes b\u00e1sicos de los nucle\u00f3tidos disponibles para construir el ADN dentro de una c\u00e9lula, pueda incorporarlos en una cadena de ADN reci\u00e9n sintetizada. Por lo tanto, el equipo investigador ha conseguido preparar una hebra de ADN que comprende nucle\u00f3tidos modificados. Al mismo tiempo, cada uno de los cuatro tipos de nucle\u00f3tidos lleva su propia etiqueta \u00fanica que permite su posterior identificaci\u00f3n. Y ese es el principal avance, ya que hasta ahora siempre hab\u00edan conseguido etiquetar y medir uno o como m\u00e1ximo dos tipos de nucle\u00f3tidos marcados con redox en una sola hebra de ADN.<\/p>\n

Como cada uno de los nucle\u00f3tidos modificados lleva su propio marcador, que durante la detecci\u00f3n electroqu\u00edmica emite una se\u00f1al de oxidaci\u00f3n espec\u00edfico a potenciales variables, se pueden distinguir los tipos individuales de nucle\u00f3tidos. Adem\u00e1s, el tama\u00f1o de cada se\u00f1al depende del n\u00famero de copias del nucle\u00f3tido dado en el ADN, lo que permite determinar r\u00e1pidamente la representaci\u00f3n relativa de los nucle\u00f3tidos individuales en el ADN medido.<\/p>\n

Esta codificaci\u00f3n electroqu\u00edmica de bases de ADN ofrece una serie de ventajas, como una instrumentaci\u00f3n m\u00e1s sencilla y asequible y un an\u00e1lisis m\u00e1s r\u00e1pidao. El m\u00e9todo es prometedor para la secuenciaci\u00f3n de ADN y aplicaciones de diagn\u00f3stico, as\u00ed como para el desarrollo de nuevos chips de ADN.<\/p>\n

El equipo investigador que lo ha hecho posible est\u00e1 encabezado por Michal Hocek, del Instituto de Qu\u00edmica Org\u00e1nica y Bioqu\u00edmica de la Academia Checa de Ciencias (IOCB Praga) y la Universidad Charles y Ciara K. O’Sullivan, de la Universitat Rovira i Virgili, la Academia de Ciencias de Polonia y el Instituto de Biof\u00edsica de la Academia de Ciencias Checo, con los estudiantes David Kodro y Cansu Pinar Yenice como primeros autores. Los resultados de la investigaci\u00f3n se han publicado en la revista cient\u00edfica Journal of the American Chemical Society.<\/em><\/p>\n

Referencia bibliogr\u00e1fica:<\/strong> Carborane- or Metallacarborane-Linked Nucleotides for Redox Labeling. Orthogonal Multipotential Coding of all Four DNA Bases for Electrochemical Analysis and Sequencing. David Kodr, Cansu Pinar Yenice, Anna Simonova, Dijana Pavlovi\u0107 Safti\u0107, Radek Pohl, Veronika S\u00fdkorov\u00e1, Mayreli Ortiz, Lud\u0115k Havran, Miroslav Fojta, Zbigniew J. Lesnikowski, Ciara K. O\u2019Sullivan, and Michal Hocek. Journal of the American Chemical Society. <\/em>DOI: <\/span>10.1021\/jacs.1c02222<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Este sistema, que permite una instrumentalizaci\u00f3n m\u00e1s sencilla y asequible y un an\u00e1lisis m\u00e1s r\u00e1pido, podr\u00e1 utilizarse para secuenciar ADN mediante detecci\u00f3n electroqu\u00edmica<\/p>\n","protected":false},"author":5,"featured_media":84235,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[117,102,3467,245,83,100,123],"tags":[],"class_list":["post-84224","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-ciencia-y-tecnologia","category-comunicacion-ciencia","category-ingenieria-quimica","category-escuela-ingenieria-quimica","category-general-es","category-investigacion","category-notas-prensa"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/84224","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/5"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=84224"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/84224\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/84235"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=84224"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=84224"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/diaridigital.urv.cat\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=84224"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}